2009年，全市審計機關緊緊圍繞市委、市政府的工作部署和工作重點，全力抓好各項審計工作，切實發(fā)揮審計保障經(jīng)濟社會健康運行的“免疫系統(tǒng)”功能。全市共完成審計和審計調(diào)查項目864個，查出違規(guī)問題金額25.04億元，促進財政增收節(jié)支11.37億元，向司法、紀檢監(jiān)察機關移送案件線索和事項13件。
    重視抓好預算執(zhí)行審計。全市審計機關依法開展了2008年度本級預算執(zhí)行和其他財政收支審計。市審計局對市財政局組織市級預算執(zhí)行情況、市地方稅務局組織地方稅收征管情況、18個市級部門預算執(zhí)行和其他財政財務收支情況進行了審計，對部門下屬210戶一級預算單位中的101戶進行了抽查。針對審計發(fā)現(xiàn)的問題，市審計局注重從政策、法規(guī)、制度、管理等層面揭示問題、分析原因，提出審計意見和建議。有關部門根據(jù)審計建議，認真落實整改，制定了139項整改措施，制訂和修訂了50項制度。浦東、徐匯、普陀、閘北、虹口、黃浦、靜安、閔行、寶山、崇明等區(qū)縣審計局，立足推進財政體制改革，積極探索新形勢下預算執(zhí)行審計工作的新方法、新思路，審計報告有事實、有數(shù)據(jù)、有典型，全面客觀反映了本級預算執(zhí)行情況，為本級人大常委會加強對預算執(zhí)行情況的監(jiān)督提供了重要依據(jù)。
    重視抓好政府投資建設項目審計。全市審計機關共審計建設項目273個，審計項目投資總額963.38億元，核減工程款18.82億元。市審計局專門召開了全市投資審計工作座談會，全面部署投資審計工作。市審計局在抓好34項重大建設項目、10項國外貸援款建設項目審計的同時，加大世博項目跟蹤審計力度，組織開展了災后重建資金和援建項目、迎世博600天行動項目和專項資金、本市擴大內(nèi)需促進經(jīng)濟增長新增投資項目、虹橋綜合交通樞紐工程項目等跟蹤審計，并研究制定了進一步加強重大工程項目動拆遷費用審計的意見。對世博項目的跟蹤審計，促使世博會建設和運營單位制定和完善制度24項。在國務院辦公廳召開的相關專題協(xié)調(diào)會上，市審計局就世博項目跟蹤審計情況作了專題匯報。同時，市審計局組織18個區(qū)縣審計局開展了迎世博600天行動項目和專項資金跟蹤審計。對災后重建項目的跟蹤審計，根據(jù)審計揭示的問題，市政府召開專題會議，要求各相關部門和單位研究落實整改措施，加強援建項目管理，完善相關管理制度。根據(jù)審計建議，相關單位制定和完善了12項制度，進一步加強了項目建設管理和資金管理。對新增投資項目的跟蹤審計，有關主管部門和項目建設單位根據(jù)審計建議，認真分析原因，積極研究整改方案，制定和修訂了3項制度，進一步規(guī)范項目建設管理，加快推進項目實施進度。浦東、長寧、普陀、閘北、黃浦、盧灣、閔行、嘉定、金山、青浦、奉賢、崇明等區(qū)縣審計局，結合擴大內(nèi)需新增投資的實際情況，不斷強化投資審計工作，創(chuàng)新投資審計管理，加強項目管理和建設成本控制，促進提高財政性建設資金投資效益。
    重視抓好專項資金審計和審計調(diào)查。全市審計機關緊緊圍繞黨委、政府重點工作和涉及群眾切身利益的熱點問題，對124項專項資金進行了審計和審計調(diào)查。市審計局重點對社會保障資金、財政支農(nóng)資金、新增汽車額度拍賣取得收入及使用管理等14項專項資金進行了審計和審計調(diào)查，注重從政策執(zhí)行、政策效應、體制機制以及管理等層面，揭示問題，分析原因，提出建議，審計質(zhì)量明顯提高。相關部門根據(jù)審計建議，認真抓好審計整改，完善了13項市級層面的管理制度。區(qū)縣審計局對社會幫困、區(qū)域性公交補貼、社區(qū)衛(wèi)生服務和農(nóng)業(yè)規(guī)模經(jīng)營補貼等民生資金進行了審計和審計調(diào)查，確保政府惠民政策落到實處。
    重視抓好領導干部經(jīng)濟責任審計工作。全市審計機關組織開展了293戶單位、350名領導干部(人員)的經(jīng)濟責任審計。市審計局對26戶市管單位30名領導干部(人員)進行了任期經(jīng)濟責任審計。把重心放在領導干部對財政財務收支以及有關經(jīng)濟活動應負經(jīng)濟責任的履行上，重點關注執(zhí)行國家方針政策措施情況，經(jīng)濟和社會事業(yè)發(fā)展情況，重大經(jīng)濟決策情況，資金資產(chǎn)管理情況，內(nèi)部控制情況，政府負債情況，遵守國家法律法規(guī)和廉政規(guī)定情況。針對審計發(fā)現(xiàn)的問題，市審計局及時研究提出審計意見和建議，督促相關單位認真抓好整改。同時，市審計局會同有關部門加強經(jīng)濟責任審計制度建設，推動經(jīng)濟責任審計工作的深化開展。各區(qū)縣審計局以促進領導干部廉政建設和提高履職水平為目標，不斷深化經(jīng)濟責任審計，為完善領導干部監(jiān)督機制，促進領導干部提高管理能力起到了積極的推動作用。
    重視抓好審計公開。市審計局按照市政府要求，逐步加大審計公開力度，2009年向社會公開了2007-2009年度重點審計項目計劃，2006、2008年度審計工作報告和審計整改報告，同時公開了社會保障資金、財政支農(nóng)資金、幫困助學資金、綠地建設補貼資金、汽車額度拍賣收入、抗震救災資金、災后恢復重建等7個單項審計結果，實現(xiàn)了本屆政府成立以來重點審計項目計劃、審計工作報告、審計整改報告全部公開，并在單項審計結果公開方面取得新的突破。各區(qū)縣審計局通過成立政府信息公開領導小組，制定和完善政府信息公開和審計公開制度，加大公開力度，積極推進政府信息公開和審計公開工作。
    重視抓好審計整改工作。市審計局加大審計整改力度，完善審計整改工作制度，提請市政府印發(fā)了《關于進一步加強審計整改工作的意見》，在健全和完善審計整改報告制度、督查制度、聯(lián)動制度、跟蹤檢查制度、問責制度、結果通報和公告制度等6項制度方面，進一步形成長效機制。
    重視抓好對內(nèi)部審計工作的指導和監(jiān)督。市審計局積極開展對內(nèi)部審計的業(yè)務指導和監(jiān)督，組織開展了各種內(nèi)部審計培訓、講座33期，參加5460人次，推動本市內(nèi)部審計工作的開展。